Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZDHHC4Q9NPG8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZDHHC4Q9NPG8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZDHHC4Q9NPG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms