Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PREBQ9HCU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREBQ9HCU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PREBQ9HCU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PREBQ9HCU5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms