Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC24A3Q9HC58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC24A3Q9HC58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC24A3Q9HC58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC24A3Q9HC58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms