Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRPEL1Q9HAV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRPEL1Q9HAV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GRPEL1Q9HAV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms