Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATSPERBQ9H7T0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CATSPERBQ9H7T0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATSPERBQ9H7T0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms