Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRN3Q9H3W5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRN3Q9H3W5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRN3Q9H3W5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRN3Q9H3W5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms