Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Y9

SLCO5A1, Solute carrier organic anion transporter family member 5A1, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO5A1Q9H2Y9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO5A1Q9H2Y9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO5A1Q9H2Y9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO5A1Q9H2Y9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms