Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNMDQ9H2S6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNMDQ9H2S6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNMDQ9H2S6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNMDQ9H2S6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNMDQ9H2S6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms