Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL25Q9H0H3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL25Q9H0H3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL25Q9H0H3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL25Q9H0H3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms