Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTDSP1Q9GZU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSP1Q9GZU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTDSP1Q9GZU7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTDSP1Q9GZU7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms