Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTPBP4Q9BZE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTPBP4Q9BZE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTPBP4Q9BZE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTPBP4Q9BZE4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms