Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PUS3Q9BZE2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PUS3Q9BZE2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PUS3Q9BZE2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PUS3Q9BZE2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PUS3Q9BZE2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PUS3Q9BZE2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PUS3Q9BZE2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PUS3Q9BZE2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms