Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPEB1Q9BZB8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPEB1Q9BZB8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPEB1Q9BZB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPEB1Q9BZB8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms