Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NSD3Q9BZ95 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD3Q9BZ95 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD3Q9BZ95 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NSD3Q9BZ95 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NSD3Q9BZ95 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms