Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PACSIN1Q9BY11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PACSIN1Q9BY11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACSIN1Q9BY11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PACSIN1Q9BY11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms