Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNHG12Q9BXW3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNHG12Q9BXW3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNHG12Q9BXW3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms