Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SELENOOQ9BVL4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SELENOOQ9BVL4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SELENOOQ9BVL4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SELENOOQ9BVL4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SELENOOQ9BVL4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms