Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
VAMP8Q9BV40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP8Q9BV40 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP8Q9BV40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms