Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2AQ9BSW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2AQ9BSW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRACR2AQ9BSW2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms