Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GORASP1Q9BQQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GORASP1Q9BQQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GORASP1Q9BQQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GORASP1Q9BQQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms