Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF1Q9BQI6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLF1Q9BQI6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLF1Q9BQI6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms