Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREX2Q9BQ50 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREX2Q9BQ50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREX2Q9BQ50 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms