Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL1Q99961 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3GL1Q99961 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3GL1Q99961 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms