Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DUSP9Q99956 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DUSP9Q99956 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP9Q99956 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP9Q99956 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP9Q99956 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms