Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD5Q99666 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD5Q99666 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD5Q99666 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD5Q99666 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD5Q99666 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms