Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HAPLN3Q96S86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HAPLN3Q96S86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HAPLN3Q96S86 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HAPLN3Q96S86 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HAPLN3Q96S86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HAPLN3Q96S86 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HAPLN3Q96S86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HAPLN3Q96S86 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HAPLN3Q96S86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms