Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN5

MED15, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED15Q96RN5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MED15Q96RN5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED15Q96RN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED15Q96RN5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MED15Q96RN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MED15Q96RN5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MED15Q96RN5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MED15Q96RN5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MED15Q96RN5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED15Q96RN5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED15Q96RN5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MED15Q96RN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MED15Q96RN5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MED15Q96RN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MED15Q96RN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MED15Q96RN5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MED15Q96RN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED15Q96RN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED15Q96RN5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED15Q96RN5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED15Q96RN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED15Q96RN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms