Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF13CQ96RJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms