Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1H4Q96RI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1H4Q96RI1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1H4Q96RI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1H4Q96RI1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1H4Q96RI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms