Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX18Q96RF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX18Q96RF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX18Q96RF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX18Q96RF0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms