Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3IPQ96QF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB3IPQ96QF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IPQ96QF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IPQ96QF0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms