Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC4A9Q96Q91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC4A9Q96Q91 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC4A9Q96Q91 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC4A9Q96Q91 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC4A9Q96Q91 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms