Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD6Q96NE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRMD6Q96NE9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD6Q96NE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6Q96NE9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms