Protein–RNA interactions for Protein: Q96N06

SPATA33, Spermatogenesis-associated protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA33Q96N06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA33Q96N06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA33Q96N06 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPATA33Q96N06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA33Q96N06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms