Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ROBO3Q96MS0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ROBO3Q96MS0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ROBO3Q96MS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ROBO3Q96MS0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ROBO3Q96MS0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms