Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NBPF4Q96M43 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NBPF4Q96M43 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF4Q96M43 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF4Q96M43 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF4Q96M43 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF4Q96M43 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms