Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PHACTR3Q96KR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PHACTR3Q96KR7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PHACTR3Q96KR7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PHACTR3Q96KR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHACTR3Q96KR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHACTR3Q96KR7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PHACTR3Q96KR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PHACTR3Q96KR7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms