Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCPIP1Q96JH7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VCPIP1Q96JH7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VCPIP1Q96JH7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPIP1Q96JH7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms