Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC12Q96J65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ABCC12Q96J65 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ABCC12Q96J65 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
ABCC12Q96J65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ABCC12Q96J65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ABCC12Q96J65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms