Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23CQ96ET8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23CQ96ET8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23CQ96ET8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms