Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
YIPF6Q96EC8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF6Q96EC8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF6Q96EC8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF6Q96EC8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms