Protein–RNA interactions for Protein: Q96E52

OMA1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OMA1Q96E52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OMA1Q96E52 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OMA1Q96E52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OMA1Q96E52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms