Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB3CQ96E17 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3CQ96E17 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB3CQ96E17 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms