Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RMDN1Q96DB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RMDN1Q96DB5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RMDN1Q96DB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RMDN1Q96DB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms