Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF21AQ96BD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF21AQ96BD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms