Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOP1MTQ969P6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP1MTQ969P6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP1MTQ969P6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP1MTQ969P6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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