Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA10Q969M2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA10Q969M2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJA10Q969M2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJA10Q969M2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA10Q969M2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms