Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT35Q92764 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT35Q92764 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT35Q92764 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT35Q92764 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms