Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATG4AQ8WYN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG4AQ8WYN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG4AQ8WYN0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4AQ8WYN0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms