Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCFD1Q8WVM8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCFD1Q8WVM8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCFD1Q8WVM8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms